Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-213ENST00000626114 598 ntTSL 511.01□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 410.65□□□□□ -0.75e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GNL3-210ENST00000492349 729 ntTSL 210.65□□□□□ -0.75e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GNL3-204ENST00000462550 597 ntTSL 210.65□□□□□ -0.75e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-210ENST00000490806 793 ntTSL 310.63□□□□□ -0.712e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PRRC1-205ENST00000512871 703 ntTSL 210.59□□□□□ -0.717e-22■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC2-207ENST00000464253 1809 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 210.56□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-202ENST00000378947 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-208ENST00000542776 821 ntTSL 210.5□□□□□ -0.732e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-201ENST00000340160 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.752e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-215ENST00000534721 510 ntTSL 310.33□□□□□ -0.762e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF239-201ENST00000306006 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.782e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-207ENST00000466673 537 ntTSL 210.09□□□□□ -0.792e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AL157392.3-236ENST00000593351 970 ntTSL 510.07□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-208ENST00000520837 565 ntTSL 49.95□□□□□ -0.822e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-217ENST00000487462 437 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-208ENST00000562321 475 ntTSL 29.47□□□□□ -0.892e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-213ENST00000488520 1155 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAH8-203ENST00000373278 955 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-217ENST00000508826 329 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-211ENST00000485450 3541 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CUTC-204ENST00000493385 612 ntTSL 38.51□□□□□ -1.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-208ENST00000502304 469 ntTSL 58.42□□□□□ -1.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-AS1-210ENST00000639576 906 ntTSL 58.37□□□□□ -1.075e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-211ENST00000565148 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.99□□□□□ -1.132e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-206ENST00000541834 653 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-209ENST00000531102 250 ntTSL 37.62□□□□□ -1.192e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-207ENST00000561654 547 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.61□□□□□ -1.192e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-207ENST00000542568 578 nt7.48□□□□□ -1.212e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-218ENST00000509195 350 ntTSL 57.32□□□□□ -1.242e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-211ENST00000479287 556 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-207ENST00000530436 604 ntTSL 37.1□□□□□ -1.278e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP4-205ENST00000563412 561 ntTSL 56.89□□□□□ -1.312e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP4-209ENST00000564511 588 ntTSL 36.8□□□□□ -1.322e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-213ENST00000533786 726 ntTSL 46.39□□□□□ -1.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-221ENST00000510524 418 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-207ENST00000518813 3722 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.452e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-211ENST00000531751 949 ntTSL 55.86□□□□□ -1.478e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC2-209ENST00000475090 480 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-209ENST00000502456 445 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-231ENST00000514275 296 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DEPDC1B-204ENST00000509006 651 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.615e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC2-208ENST00000475065 1952 ntTSL 1 (best)3.12□□□□□ -1.912e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 517.5■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 514.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 372.3
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-208ENST00000555894 738 ntTSL 316.25■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 371.9
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 212.37□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 371.9
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 522.85■■□□□ 1.254e-9■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-206ENST00000564709 2316 ntTSL 224.27■■□□□ 1.483e-7■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-209ENST00000567868 1628 ntTSL 324.09■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-211ENST00000569380 1781 ntTSL 222.14■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-204ENST00000563741 1746 ntTSL 520.84■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 371.5
UTP3Q9NQZ2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-11■■■■■ 371
UTP3Q9NQZ2 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 371
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.838e-9■■■■■ 370.2
UTP3Q9NQZ2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 369.4
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-205ENST00000585674 526 ntTSL 48.84□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 369
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-211ENST00000587878 344 ntTSL 38.65□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 369
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 27.68□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 369
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-206ENST00000555005 2730 ntTSL 212.79□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 368.8
UTP3Q9NQZ2 MCUR1-202ENST00000488770 1826 ntTSL 222.5■■□□□ 1.198e-8■■■■■ 368
UTP3Q9NQZ2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 368
UTP3Q9NQZ2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.85■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 367.8
UTP3Q9NQZ2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 367.5
UTP3Q9NQZ2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 367.5
UTP3Q9NQZ2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 367.5
UTP3Q9NQZ2 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 367.5
UTP3Q9NQZ2 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 367.5
UTP3Q9NQZ2 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 366.8
UTP3Q9NQZ2 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 366.8
UTP3Q9NQZ2 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 366.8
UTP3Q9NQZ2 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 366.4
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-204ENST00000504029 593 ntTSL 420.49■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.977e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 365.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.067e-8■■■■■ 365.5
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