Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMMDC1Q9NPL8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms