Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSU72Q9NP77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.9 ms