Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms