Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLMPQ9H6B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms