Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG10Q9H0Y0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG10Q9H0Y0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms