Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4CQ9C0C4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4CQ9C0C4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms