Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLVAPQ9BX97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLVAPQ9BX97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLVAPQ9BX97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms