Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HIGD2AQ9BW72 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms