Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PBDC1Q9BVG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PBDC1Q9BVG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PBDC1Q9BVG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms