Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNS3Q9BQ31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNS3Q9BQ31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms