Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP4Q96MN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms