Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf85Q96MD7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms