Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC114Q96M63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms