Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX27Q96L92 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms