Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMX3Q96JJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX3Q96JJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX3Q96JJ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms