Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52L3Q96J77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms