Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1AQ96CP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD1AQ96CP6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms