Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf44Q96CB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms