Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms