Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATA6Q92908 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA6Q92908 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms