Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNQ92622 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNQ92622 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNQ92622 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms