Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPDL3AQ92484 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPDL3AQ92484 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms