Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3IL1Q8TBN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms