Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATJQ8NI35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms