Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF397Q8NF99 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF397Q8NF99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF397Q8NF99 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms