Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM35BQ8NCS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms