Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC5Q8NAU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms