Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO39Q8N4B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO39Q8N4B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms