Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00518Q8N0U6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms