Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z699

SPRED1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1Q7Z699 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED1Q7Z699 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED1Q7Z699 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED1Q7Z699 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms