Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIPA1Q7RTP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIPA1Q7RTP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPA1Q7RTP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms