Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47EQ6ZV65 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47EQ6ZV65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms