Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHISA6Q6ZSJ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms