Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP6Q6ZN66 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms