Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPTNQ6XPR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPTNQ6XPR3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms