Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC137Q6PK04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC137Q6PK04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms