Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A3Q6PIS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A3Q6PIS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A3Q6PIS1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms