Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RCSD1Q6JBY9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCSD1Q6JBY9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms