Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN2Q6IMN6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms