Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HES3Q5TGS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms