Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDGFL1Q5TGJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDGFL1Q5TGJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDGFL1Q5TGJ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms