Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD5Q5TGI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms