Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XKR3Q5GH77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XKR3Q5GH77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XKR3Q5GH77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms