Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPROQ16827 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPROQ16827 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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