Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TLR1Q15399 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms