Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC3Q15034 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC3Q15034 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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