Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP5Q14008 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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