Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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ITGA9Q13797 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA9Q13797 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA9Q13797 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
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