Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAE1Q13564 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAE1Q13564 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAE1Q13564 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1134.4 ms